Im Dezember 1993 trafen sich auf Anregung des Gewandhausorganisten Michael Schönheit Gesangsabsolventen und –studenten mit den Leipziger Vocalsolisten und den Leipziger Bachsolisten zur Aufführung des Bachschen Weihnachtsoratoriums in den Historischen Kuranlagen Bad Lauchstädt. Die Begeisterung der jungen Sänger und der Erfolg dieser Konzerte veranlassten die Gründung des Collegium Vocale Leipzig. Das Ensemble widmet sich in kleinstmöglicher Besetzung überwiegend der Aufführung und Pflege mitteldeutscher Barockmusik, wobei die Werke von Heinrich Schütz und seinen Zeitgenossen sowie Johann Sebastian Bachs im Mittelpunkt stehen. Ist eine größere Besetzung erforderlich, arbeitet das Ensemble gern mit dem Kammerchor der Schlosskapelle Saalfeld zusammen. Gemeinsam mit der Merseburger Hofmusik, aber auch verschiedenen anderen Orchestern, kam es meist unter der Leitung von Michael Schönheit zu einer Vielzahl von Kantaten- und Oratorienaufführungen. Im Rahmen der jährlich stattfindenden Merseburger Orgeltage erklang 2010 Bachs „Matthäus-Passion“ nach historischer Besetzungsvorgabe, 2016 wirkte das Collegium Vocale bei der Uraufführung von Steffen Schleiermachers Nach Markus.Passion (2015) nach einem Text von Christian Lehnert unter Verwendung der überlieferten Teile von Johann Sebastian Bachs Markus-Passion BWV 247 in Oslo und zum Bachfest Leipzig mit.
Im November des Jahres 2019 reiste das Ensemble als Repräsentant der Bundesrepublik Deutschland anläßlich der Feierlichkeiten „500 Jahre Havanna“  gemeinsam mit der Merseburger Hofmusik und Solisten für mehrere Konzerte mit Musik von J.S.Bach nach Kuba. Im schwierigen Jahr 2020 konnte das Collegium an mehreren Aufführungen von chorsinfonischen Werken Beethovens mitwirken, so u.a. an den Festkonzerten 30 Jahre Deutsche Einheit der Städte Saalfeld und Merseburg.
Im September fand als Eröffnungskonzert der 50. Merseburger Orgeltage ein a capella-Konzert mit Motetten von J.S.Bach statt, das vom mdr Kultur übernommen wurde.